第1章　定量的RT-PCR
1　半定量的RT-PCR
　1-1　逆転写
　1-2　サイクル数の検討
　1-3　異なる試料のPCR
　1-4　定量（オプション）
2　競合的（competitive）PCR法
　2-1　内部コントロールの競合的PCRによるRNA量の補正
　2-2　Competitor DNAの作製
　2-3　競合PCR
3　リアルタイムPCR
　3-1　SYBR Green I法
　3-2　TaqMan法
　＜コラム＞リアルタイムPCRを用いた定量の解析例

第2章　whole-mount in situハイブリダイゼーション
1　概要
　1-1　in situハイブリダイゼーション（ISH）
　1-2　whole-mount in situハイブリダイゼーション（WISH）
　1-3　InSituチップ
　1-4　プローブ
　1-5　固定
2　サンプルの固定
3　プローブ合成
　3-1　テンプレート調製
　3-2　RNA合成
　3-3　合成したプローブの定量
4　ハイブリダイゼーション
　4-1　固定サンプルのエタノールダウンシリーズ
　4-2　InSituチップのセットアップ
　4-3　染色

第3章　SDS電気泳動とウエスタンブロッティング
1　SDS電気泳動
　1-1　サンプル調製
　1-2　泳動槽のセットアップ
　1-3　サンプルの注入
　1-4　泳動の開始
　1-5　泳動の終了
　1-6　後片付け
2　ゲルの染色と乾燥
　2-1　ゲルの染色・脱色
　2-2　ゲルの乾燥
3　ウエスタンブロッティング
　3-1　PVDFメンブレンのプレウエッティグ
　3-2　ブロッティング
　3-3　後片付け
4　CBBによるメンブレンの染色
5　免疫染色
　5-1　ブロッキング
　5-2　一次抗体
　5-3　一次抗体の洗浄
　5-4　二次抗体
　5-5　二次抗体の洗浄
6　免疫染色の検出
　6-1　AP/BCIP（発色反応による検出）
　6-2　HRP/ECL（化学発光による検出）
　＜コラム＞SYPRO染色

第4章　融合タンパク質発現プラスミドの構築
1　融合タンパク質作製のためのプロトコール作成
2　発現系の選択
　2-1　大腸菌での発現系
　2-2　大腸菌以外での発現系
3　GST融合タンパク質発現プラスミドの構築
　3-1　GSTタグとは
　3-2　GSTタグ配列を持つベクター
　3-3　抗原タンパク質
　3-4　方針
　3-5　PCRプライマーの設計
＜参考＞ タグ配列とは

第5章　融合タンパク質の大腸菌での発現

1　大腸菌の培養および発現誘導条件の検討
2　融合タンパク質分画の確認
3　大腸菌の大量培養と発現誘導
4　融合タンパク質分画の回収
　4-1　培養上清に分泌される場合
　4-2　ペリプラズムに分泌される場合
　4-3　大腸菌内にありPBSで可溶化できる状態になっている場合
　4-4　大腸菌内にありPBSで可溶化できないがインクルージョンボディーではない場合
　4-5　大腸菌内にありインクルージョンボディーになっている場合
5　アフィニティーレジンでの精製
　5-1　レジンへの吸着
　5-2　アフィニティーレジンの洗浄
　5-3　レジンからの溶出
　5-4　タグ配列の切断

第6章　免疫沈降とpull downアッセイ
1　目的分子の可溶化
　1-1　細胞のホモジェナイズ
　1-2　目的分子を含む分画の確認
2　免疫沈降操作
　2-1　プロテインGセファロースへの抗体の吸着
　2-2　抗体結合後のレジンの洗浄
　2-3　目的分子を含む分画との反応
　2-4　目的分子結合後のレジンの洗浄
　2-5　結果の判定
3　pull downアッセイ

第7章　培養細胞とトランスフェクション
1　培養細胞
2　培養細胞を扱う際に必要な無菌操作
3　無菌操作の注意事項
　3-1　培養室の環境整備
　3-2　クリーンベンチ内の環境維持
　3-3　実験者の清浄性の維持
　3-4　クリーンベンチ内での作業中
4　浮遊細胞の培養
　4-1　解凍
　4-2　継代培養（植え継ぎ）
　4-3　凍結保存
5　付着細胞の培養
　5-1　解凍
　5-2　継代培養（植え継ぎ）
　5-3　培地交換
　5-4　凍結保存
6　遺伝子導入試薬による形質転換
7　エレクトロポレーションによる形質転換

第8章　ルシフェラーゼアッセイ
1　ルシフェラーゼアッセイでできること
　1-1　遺伝子のエンハンサー/プロモーターのシス解析
　1-2　転写因子のドメイン解析
　1-3　DNA結合ドメイン解析
　1-4　siRNAの活性の検定
　1-5　翻訳を制御するRNA結合タンパク質の解析
　1-6　非常に弱いプロモーターをもつ遺伝子の生体内での発現をモニターする
　1-7　細胞内の微量な酵素の活性を定量する
　1-8　two-hybridアッセイ
2　ベクターと基質の選択
　2-1　コントロールの選択
　2-2　フラッシュアッセイかグローアッセイか
　2-3　転写の時間的変化や刺激反応性をみたい場合
　2-4　生きた細胞で継続的にリアルタイム測定をしたい場合
3　Dualルシフェラーゼアッセイによる活性の測定

第9章　two-hybrid法
1　3つのシステムの比較
　1-1　大腸菌
　1-2　酵母
　1-3　培養細胞
2　大腸菌ベースのtwo-hybrid法
　2-1　ベイトの準備
　2-2　ライブラリーの準備
　2-3　スクリーニング
3　酵母ベースのtwo-hybrid法
　3-1　コンベンショナルなtwo-hybridシステム
　3-2　CytoTrapシステム
4　動物細胞ベースのtwo-hybrid法

第10章　バイオインフォマティクスの初歩
1　塩基配列の処理と情報検索
　1-1　塩基配列の加工
　1-2　少数のファイル間での配列比較
　1-3　比較したい配列を検索する
　1-4　ウェブ上のデータベースを使った配列データ解析の初歩
　1-5　ウェブ上のツールを使った塩基配列データ解析の初歩
2　既存の塩基配列，アミノ酸配列等のデータベースを利用する解析の初歩
　2-1　ゲノムデータベースを利用する
　2-2　ゲノムデータと実験データをともに利用した実験例
　2-3　cDNAデータベースを利用する
　2-4　大量データからのマイニング
3　ウェブを利用した文献検索の初歩
　3-1　単純なキーワードサーチ
　3-2　検索式を用いた組み合わせ検索
　3-3　BioMailによる関連論文の自動検索

第11章　バイオ実験に関連する法律と規制
1　カルタヘナ法
　1-1　安全取り扱いの配慮が必要な理由
　1-2　カルタヘナ法は何を規制しているか
　1-3　使用等にはどのようなものが含まれるか
　1-4　遺伝子組換え実験計画書
　1-5　拡散防止措置と物理的封じ込め（physical containment）
　1-6　保管にあたって執るべき措置
　1-7　運搬にあたって執るべき措置
　1-8　譲渡をするとき，されるときに執るべき措置
　1-9　輸出入にあたってとるべき措置
＜コラム＞ 法令と各研究機関の規則
2　その他の生命科学実験の安全や倫理問題
　2-1　生命倫理に関する問題点
　2-2　ライフサイエンスにおける安全に関する問題点

付録　試薬の組成・調製法と遺伝子組換え実験の表示例
1　試薬の組成と調製法
　1-1　一般的な試薬
　1-2　細胞培養培地用の試薬
　1-3　細胞培養培地の作製
2　遺伝子組換え実験の表示