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最新プロテオミクス実験プロトコール

シリーズ:
細胞工学  > 細胞工学別冊
 |   細胞工学  > プロトコールシリーズ

細胞工学別冊  最新プロテオミクス実験プロトコール 

著:
谷口寿章(徳島大学分子酵素学研究センター/理化学研究所播磨研究所)
頁数:
200ページ
定価:
本体4,700円(税別)
発行年月:
2003年12月18日発行
ISBN_10:
4-87962-270-2
ISBN_13:
978-4-87962-270-9

「細胞工学」好評連載を大改訂 単行本化.理研谷口ラボの秘伝伝授.質量分析を使いこなすために必携の一冊.

第1章 導入編 プロテオミクスとその解析技術
I.プロテオームとプロテオミクス
II.ゲノム情報と質量分析を基盤にしたプロテオーム解析技術
III.解析の流れ

第2章 質量分析のためのゲル染色法
I.質量分析用の銀染色
II.市販の銀染色キット, 他の染色法との比較(染色性)
III.市販の銀染色キット, 他の染色法との比較(質量分析による解析)

第3章 プロテアーゼによるゲル内消化
I.ゲル内消化のプロトコール
II.多数の試料の同時処理

第4章 サンプルの脱塩法
I.脱塩法の原理
II.ナノカラムを自作する
III.ZipTipを用いた脱塩法
IV.C18以外の担体と, 様々な工夫

第5章 MALDI-TOF質量分析計による測定
I.MALDI-TOF MSによる質量分析
II.マススペクトルの評価

第6章 PMF法によるタンパク質同定, データベース検索
I.ピークリストの作製
II.代表的な検索サイトを利用した検索

第7章 Q-TOF型質量分析計によるマススペクトル測定, MS/MS測定
I.ESI-Q-TOFによる質量分析
II.測定の準備
III.マススペクトルの測定
IV.MS/MSスペクトルの測定
V.キャリブレーション

第8章 キャピラリー高速液体クロマトグラフィー
I.キャピラリーHPLCの原理と実際

第9章 LC/MS/MS測定
I.ナノスプレー・イオン源
II.測定パラメーターの設定
III.実際の自動LC/MS/MS測定

第10章 イオントラップを使ってみよう
I.イオントラップ型質量分析計の原理
II.ナノスプレー・イオン源
III.測定準備
IV.インフュージョンによるマススペクトルの測定
V.LC/MSの測定

第11章 MS/MSスペクトルの解釈とシークエンスタグ
I.スペクトルの処理
II.MS/MSスペクトルからアミノ酸配列を読む
III.ソフトウェアを使う

第12章 MS/MS解析によるデータベース検索
I.MS/MSスペクトルからのピークリスト作成
II.MS/MS解析からの,インターネットを介したデータベース検索
III.自動検索ツール

第13章 タンパク質翻訳後修飾の解析
I.プリカーサースキャン法の原理
II.解析法の概要
III.ネガティブモードでのMS測定
IV.プリカーサースキャン
V.ポジティブモードのMS/MS測定
VI.LC/MSでのプリカーサースキャン

第14章 ディファレンシャル解析
I.原理
II.ラベル試薬による標識反応とトリプシン処理
III.陽イオン交換樹脂カートリッジによる過剰試薬の除去
IV.アビジンカラムによる標識ペプチド精製とビオチニル基の切断
V.サンプルの脱塩とマススペクトルの測定

コラム
播磨プロテオミクス・サマースクール

付録
プロテオミクスのためのウェブサイト